В почвах всех типов можно найти разнообразных амеб, жгутиковых, инфузорий. Они живут в щелях почвы, заполненных водой питаются грунтовыми бактериями, водорослями, грибами и остатками организмов.

Необходимое условие для жизни простейших в почве наличие влаги. Засуху они, как и пресноводные одноклеточные, переносят в виде цист.Характерной особенностью грунтовых простейших являются их мелкие размеры, которые могут быть в 10 раз меньшие, чем у близких к ним видов, которые проживают в пресных водоемах или морях. Это предопределено незначительным диаметром щелей почвы, в которых живут эти животные. Количество простейших может достигать нескольких сотен тысяч организмов в 1 г почвы, а масса — 30— 40 г/м квадратный. Раскладывая органические вещества, простейшие принимают участие в процессах почвообразования.